根据《中华人民共和国户口登记条例》，只有合法住宅的房屋才能办理公民户口登记，包括农民合法自建房和城镇地区的住宅商品房。但商业性质的商品房、非住宅性质的门面店铺和小产权房屋都不能办理户口迁移手续。
根据该条例的规定，公民迁移后需要在三天（城市）或十天（农村）内向户口登记机关申报迁入登记，并缴销迁移证件。没有迁移证件的公民可以凭其他证件到迁入地的户口登记机关申报迁入登记。
被假释、缓刑的犯人，被管制分子和其他被剥夺政治权利的人，在迁移时需要经过户口登记机关转报相应机关批准，才能办理迁出登记。
如果公民在常住地市、县范围以外的城市暂住三天以上，需要在三天内向户口登记机关申报暂住登记，离开前需要申报注销。暂住在旅店的公民需要在旅客登记簿上登记。
户口登记的内容需要变更或更正时，需要户主或本人向户口登记机关申报，经审查属实后才能进行变更或更正。在必要的情况下，户口登记机关可以要求申请人提供相关的证明。
公民如果需要变更姓名，未满18周岁的需要本人、父母或收养人向户口登记机关申请变更登记，而18周岁以上的需要本人亲自去申请变更登记。
综上所述，商铺无论是否由合法住宅改造而成，都不能办理户口迁移手续。
